Morteau est attestée sous la forme Mortua Aqua dès 1107 — « l’eau morte », désignant un méandre ou une zone peu courante de la rivière. Bourg du Haut-Doubs dans la vallée de la Loue à la frontière suisse, la commune fut éprouvée par dix-sept incendies en huit siècles, dont les plus destructeurs frappèrent en 1639, 1683, 1702, 1849 et 1865. Elle est aujourd’hui connue pour la saucisse de Morteau, charcuterie fumée au bois de résineux protégée par une indication géographique protégée.
Mortua Aqua (1107) — « eau morte » en latin — désignait un secteur stagnant ou un méandre du cours d’eau. La forme évolua vers Morteals, Mortal puis Morteau.
L’église de l’Assomption-de-Notre-Dame et la chapelle Saint-Pierre-et-Saint-Paul assurent la vie paroissiale de cette commune du Haut-Doubs.