Charantonnay vient d’un anthroponyme gallo-romain (Carantinus ou Charantinus) suivi du suffixe -acum/-ay/-onnay, désignant le domaine de Carantinus dans le Bas-Dauphiné isérois médiéval.
L’église paroissiale de Charantonnay est le centre paroissial de cette commune du Bas-Dauphiné. Elle accueille les fidèles catholiques du bourg dans le cadre de la paroisse de secteur du nord de l’Isère.