Le nom de Fleury dérive du latin Floriacum. Mérogis est un anthroponyme médiéval lié à un ancien hameau ou domaine. La fusion des deux entités forma le nom composé actuel.
L’église paroissiale de Fleury-Mérogis, édifice roman remanié, constitue le monument central du village historique. Elle appartient au réseau paroissial de l’agglomération du sud parisien.