Le nom de Nogent dérive du latin Novientum, « nouveau lieu » ou « nouveau marché ». Le qualificatif « sur-Vernisson » désigne la rivière qui traverse la commune. L’arboretum des Barres, créé en 1821, est un patrimoine naturel et scientifique du Gâtinais.
L’église paroissiale de Nogent-sur-Vernisson, édifice roman du Gâtinais forestier, constitue le monument religieux de ce bourg scientifique et naturel. Elle appartient au regroupement paroissial du secteur de Gien.