Noyen vient du latin Noionum ou du vieux français noyer (noyer, Juglans regia), désignant un lieu planté de noyers dans la vallée de la Sarthe. Le qualificatif fluvial « sur-Sarthe » précise la position au bord de la rivière sarthoise.
L’église paroissiale de Noyen-sur-Sarthe est le centre paroissial de ce bourg de la vallée de la Sarthe. Elle accueille les fidèles catholiques de cette commune dans ce secteur agricole et fluvial de l’ouest sarthois.